Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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C1orf61Q13536 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1orf61Q13536 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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