Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GPM6BQ13491 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms