Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SCGB2A2Q13296 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCGB2A2Q13296 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms