Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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