Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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