Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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CHAF1AQ13111 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1AQ13111 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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