Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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IFT88Q13099 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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IFT88Q13099 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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IFT88Q13099 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFT88Q13099 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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