Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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