Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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