Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXF1Q12946 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXF1Q12946 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXF1Q12946 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FOXF1Q12946 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXF1Q12946 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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