Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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