Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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KCNMA1Q12791 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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