Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOBRQ0VD83 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms