Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf54Q08AI8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms