Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRNB3Q05901 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB3Q05901 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms