Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms