Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms