Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DSG1Q02413 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DSG1Q02413 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms