Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC6A3Q01959 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC6A3Q01959 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms