Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms