Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC10Q01780 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC10Q01780 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms