Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MDM2Q00987 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms