Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms