Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms