Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIM1P81133 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIM1P81133 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SIM1P81133 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SIM1P81133 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SIM1P81133 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIM1P81133 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SIM1P81133 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms