Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM193AP78312 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms