Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPNP63162 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms