Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD2P62316 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPD2P62316 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms