Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UFM1P61960 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms