Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVPABLB-1P60509 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms