Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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FAM3BP58499 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3BP58499 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3BP58499 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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