Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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