Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC6A9P48067 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC6A9P48067 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms