Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACADSBP45954 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms