Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA1P42261 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms