Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPOP42166 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMPOP42166 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms