Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARGP37231 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms