Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TGFBR1P36897 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGFBR1P36897 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms