Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms