Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCC1P33527 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms