Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC12P31275 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC12P31275 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC12P31275 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC12P31275 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC12P31275 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms