Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRMP28827 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms