Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RXRBP28702 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RXRBP28702 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RXRBP28702 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RXRBP28702 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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