Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLD1P28340 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLD1P28340 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms