Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMB4P28070 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms