Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB9P28065 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms