Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APEX1P27695 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APEX1P27695 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms