Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ITGA3P26006 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms