Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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