Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB9P17482 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms